دقیقاً چه کاری باید انجام شود؟
به یک متخصص پردازش تصاویر MRI مغز با تجربه عملی در MRI بیماران مبتلا به Multiple Sclerosis (MS) نیاز داریم.
فایل‌های MRI مربوط به بیماران به‌صورت DICOM در اختیار شما قرار می‌گیرد و Seriesهای موردنظر T1 و FLAIR برای هر بیمار نیز مشخص و در اختیار شما قرار خواهد گرفت.
هدف این است که پردازش تصاویر از مرحله MRI خام تا خروجی نهایی آماده برای تحلیل به‌صورت کامل انجام شود.
شرح کار برای هر بیمار، فایل‌های T1 و FLAIR در اختیار شما قرار می‌گیرد.
کار موردنظر شامل: 1.
آماده‌سازی و بررسی تصاویر MRI 2.
سگمنتیشن ضایعات MS با استفاده از FLAIR و در صورت نیاز T1 3.
بررسی و اصلاح ماسک ضایعات در صورت نیاز 4.
Registration تصاویر و انتقال به فضای استاندارد MNI 5.
انتقال صحیح Lesion Mask به فضای MNI 6.
کنترل نهایی کیفیت (QC) در نماهای مختلف
روش انجام کار (خودکار، نیمه‌خودکار یا Deep Learning) بر اساس روش مناسب توسط متخصص انتخاب می‌شود.
خروجی مورد انتظار برای هر بیمار:
- FLAIR پردازش‌شده
- T1 پردازش‌شده
- Lesion Mask در native space
- Lesion Mask در MNI space
- ساختار فایل‌ها به‌صورت منظم و قابل استفاده برای تحلیل بعدی
نکته بسیار مهم: صرفاً اجرای یک نرم‌افزار segmentation یا registration موردنظر نیست.
خروجی باید از نظر کیفیت تصویری و فضایی QC شده و قابل استفاده برای مرحله بعدی تحلیل باشد.
همچنین قبل از انجام کل پروژه، یک بیمار به‌عنوان نمونه/پایلوت پردازش و تأیید خواهد شد و پس از تأیید روش، پردازش سایر بیماران انجام می‌شود.
شرایط موردنیاز
- تجربه عملی در MRI Brain Processing
- تجربه در MS Lesion Segmentation
- تسلط به حداقل یکی از ابزارهای پردازش MRI
- یا ابزارهای تخصصی مشابه
- آشنایی با Registration و MNI Space
- آشنایی با روش‌های automated / semi-automated / deep learning segmentation مزیت محسوب می‌شود.
- تجربه عملی و نمونه‌کار مرتبط با Lesion Segmentation در MS امتیاز بسیار مهمی است.
فایل‌های T1 و FLAIR هر بیمار توسط کارفرما در اختیار متخصص قرار می‌گیرد و نیازی به انتخاب Series از میان کل داده‌های خام نیست.